Установка Truecrypt на этой версии CentOS требует некоторых дополнительных действий.

Скорее всего система спросит у Вас libfuse.so.2… Установим, чего не хватает:

# rpm -ihv ftp://rpmfind.net/linux/centos/6.8/os/x86_64/Packages/fuse-libs-2.8.3-5.el6.x86_64.rpm

Возможно, Вам придется еще обновить ядро до более нового (3.10, например). Как это сделать, описано в этой статье.

После этих действи Truecrypt наверняка должен стать без проблем. Выполняем:

# ./truecrypt-7.1a-setup-console-x64

Нажимаем 1 (установка), потом q, соглашаемся с условиями yes, и Enter.